一、国家地方联合工程实验室

血管植入物开发国家地方联合工程实验室

二、教育部重点实验室

生物流变科学与技术教育部重点实验室

三、教育部工程研究中心

肿瘤与病菌靶向新药创制教育部工程研究中心

四、教育部医药基础研究创新中心

智能肿瘤学医药基础研究创新中心

五、其它部委平台

国家生物产业基地公共实验中心（国家发改委）

六、重庆市重点实验室

生物感知与智能信息处理重庆市重点实验室

天然产物全合成与创新药物研究重庆市重点实验室

肿瘤转移与个体化诊治转化研究重庆市重点实验室

乳腺癌智能诊疗重庆市重点实验室

急诊医学重庆市重点实验室

神经变性病重庆市重点实验室

肝胆胰疾病智慧诊疗工程重庆市重点实验室

生物计算安全重庆市重点实验室

重大疾病标志物与智慧检验重庆市重点实验室

心脑血管损伤与修复研究重庆市重点实验室

七、重庆市工程技术研究中心

重庆市医疗电子工程技术研究中心

重庆市血液净化装备工程技术研究中心

八、重庆市临床医学研究中心

重庆市肿瘤学临床医学研究中心

重庆市内分泌代谢病学临床医学研究中心

重庆市老年疾病临床医学研究中心

重庆市心血管外科学临床医学研究中心

重庆市检验医学临床医学研究中心

重庆市耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心

九、重庆市工程研究中心

肿瘤临床多组学大数据应用重庆市工程研究中心

十、重庆高校市级重点实验室

生物医学工程重点实验室

十一、重庆市人文社科普及基地

医务社会工作实践研究基地